„Баща неизвестен” проследява историята на двайсетгодишната ДжоЕлън Марш, предприела търсене на донора на сперма, който се явява нейн баща и когото знае само като „Донор 150”.
Джо Елън винаги е знаела, че нейното семейство „не е като другите”. Тя израства в Пенсилвания с две майки и изгарящото любопитство да научи повече за своя анонимен баща – донор. Когато ДжоЕлън открива уникален електронен регистър, който свързва деца, заченати със сперма от донори, тя успява да проследи своя полусестра от Ню Йорк. Вестник „Ню Йорк Таймс” се заема с този случай и с течение на времето се откриват още 12 полу-братя и сестри из цяла Америка.
Статията на „Ню Йорк Таймс” попада и в ръцете на Джефри Харисън, който живее сам с четирите си кучета и един гълъб в порутена каравана на паркинг на Венис бийч, Калифорния. През 80-те години Джефри допълвал оскъдния си доход, като станал донор на сперма в Калифорнийската криобанка. Неговият номер бил „Донор 150”.
„Баща неизвестен” проследява ДжоЕлън от момента, когато открива братята и сестрите си, през момента, в който Джефри се идентифицира като Донор 150, до решението й да замине за Калифорния и да се запознае с него. По пътя срещаме част от нейните полу братя и сестри по бащина линия.
„Баща неизвестен” е филм за един нов вид „семейство”. Свързани с един и същ донор на сперма – номер 150 – родители и деца създават и откриват пътищата към нов вид взаимоотношения. Те откриват от първа ръка какво означава за тях самите и за тяхната самоличност близката биологическа връзка с един напълно непознат човек. Онова, което се случва, повдига удивителни въпроси относно природата и родителските грижи, отговорностите на родителите, морала и почтеността на криобанките за донори и опасностите на генетическото наследство.